Kemiallisissa ja fysikaalisissa väärentämisenvastaisissa teknologioissa käytetään erityisiä aineita esineiden merkitsemiseen ja tarkistamiseen. Niissä hyödynnetään tiettyjen kemiallisten prosessien tai aineiden soveltamisessa materiaaleihin syntyvien kuvioiden luontaista satunnaisuutta, ja ne toimivat merkintöinä.

Näiden teknologioiden päätarkoituksena on todentaminen ilman samanaikaista tuotteen yksilöllistä tunnistamista. Niiden luomien merkkien lukemiseen ja todentamiseen tarvitaan erikoislaitteita tai laboratoriotestejä. Tämän vuoksi kolmansien osapuolten on erittäin vaikeaa jäljentää samanlaisia merkkejä. 

Kemiallisten ja fysikaalisten merkintöjen luomiseen ja kiinnittämiseen liittyvät kustannukset ovat yleensä alhaiset. Erikoistuneet automaattiset lukulaitteet voivat kuitenkin olla kalliita, jos niitä tarvitaan. Siksi on syytä muistaa, että välitön tarkastus paikan päällä ei useinkaan ole mahdollista. Sen sijaan laboratorioiden on suoritettava testaus, mikä vaatii enemmän aikaa.